RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-201ENST00000253024 CUL3Q13618 768 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 DCLK2Q8N568 766 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SGF29Q96ES7 293 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 C7orf26Q96N11 449 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SIK2Q9H0K1 926 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 BATF3Q9NR55 127 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ASB14A6NK59 587 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 MAP3K7O43318 606 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 BCAT1P54687 386 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 MBLAC2Q68D91 279 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 USP17L7P0C7H9 530 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 DEUP1Q05D60 604 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 NAPRTQ6XQN6 538 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 RAPH1Q70E73 1250 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 THAP1Q9NVV9 213 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 MOCS1Q9NZB8 636 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 AK5Q9Y6K8 562 aa21.87■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PLIN3O60664 434 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 CACNA2D1P54289 1103 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 CDKL2Q92772 493 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ATP2A3Q93084 1043 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 CHRNGP07510 517 aa21.86■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 TKTL1P51854 596 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 WASHC5Q12768 1159 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 CFAP157Q5JU67 520 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SNX15Q9NRS6 342 aa21.86■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 E7ENQ6 273 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 TXNDC9O14530 226 aa21.85■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 SIN3BO75182 1162 aa21.85■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 ANPEPP15144 967 aa21.85■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 FAM187BQ17R55 369 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SNX31Q8N9S9 440 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PPTC7Q8NI37 304 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 LPPQ93052 612 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 DPYSL4O14531 572 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 CFLARO15519 480 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 RALBP11234 206 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ERCC2P18074 760 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 MAGEA3P43357 314 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 KRT72Q14CN4 511 aa21.85■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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TRIM28-201ENST00000253024 NPWQ8N729 165 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 MAPK15Q8TD08 544 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.85■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 POLE2P56282 527 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 42.5
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TRIM28-201ENST00000253024 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 FZD10Q9ULW2 581 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 TK2O00142 265 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 PDHXO00330 501 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 AIM2O14862 343 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 HSPA4LO95757 839 aa21.84■■□□□ 1.09
TRIM28-201ENST00000253024 MMP3P08254 477 aa21.84■■□□□ 1.09
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