RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 COX4I1P13073 169 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 GOT1P17174 413 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 BIRC2Q13490 618 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL21CQ5VZV1 264 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 HPS6Q86YV9 775 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD9Q96Q07 612 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 CPNE1Q99829 537 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.71■■□□□ 1.23
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CUL3Q13618 768 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF12Q96FN5 646 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 HAPLN3Q96S86 360 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 RTKNQ9BST9 563 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH19Q9H159 772 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 AP1G1O43747 822 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2C8P10632 490 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 RAG1P15918 1043 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 GLUD2P49448 558 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 COPS5Q92905 334 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK16Q96T55 309 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX15Q9NRS6 342 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 F5H423 210 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF103O00237 685 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 POLBP06746 335 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 NUMBP49757 651 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 KLF10Q13118 480 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 STRADAQ7RTN6 431 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CERS2Q96G23 380 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 COG4Q9H9E3 785 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB14O43829 449 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT34O76011 436 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ARL4AP40617 200 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 DLG1Q12959 904 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 UNC93AQ86WB7 457 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 P2RY11Q96G91 374 aa22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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HTATSF1-201ENST00000218364 DCXO43602 365 aa22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVK-10P10266 1014 aa22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIP10Q15642 601 aa22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.68■■□□□ 1.22
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF358Q9NW07 568 aa22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FZD10Q9ULW2 581 aa22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM114B3SHH9 223 aa22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD11O43934 449 aa22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 INSRRP14616 1297 aa22.68■■□□□ 1.22
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HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.68■■□□□ 1.22
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HTATSF1-201ENST00000218364 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 NME8Q8N427 588 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 DCLK2Q8N568 766 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN1O60635 241 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMB4P28070 264 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 MLH1P40692 756 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINB8P50452 374 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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HTATSF1-201ENST00000218364 UGT2A3Q6UWM9 527 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 G3V2L1 256 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 GRM5P41594 1212 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 USP4Q13107 963 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX6Q13608 980 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.67■■□□□ 1.22
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