RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccnb1P24860 430 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FynP39688 537 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubgcp3P58854 905 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bcar1Q61140 874 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gja6Q6S5G4 283 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fra10ac1Q8BP78 315 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MyocdQ8VIM5 935 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pold3Q9EQ28 462 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wnt8bQ9WUD6 350 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt10P02535 570 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BpgmP15327 259 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mief2Q5NCS9 454 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim61Q8JZK6 461 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myoz3Q8R4E4 245 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rabep2Q91WG2 554 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MrgpreQ91ZB7 310 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdelc1Q9JHP7 502 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr600E9PUN7 314 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RpsaP14206 295 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acot8P58137 320 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Samd11Q1RNF8 542 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aarsd1Q3THG9 412 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfyve27Q3TXX3 415 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp4aQ64436 1033 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ProcrQ64695 242 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pth2rQ91V95 546 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf536Q8K083 1302 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo16Q5DU14 1919 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sept7O55131 436 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cbfa2t2O70374 594 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp2a3Q64518 1038 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nacc1Q7TSZ8 514 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rimbp2Q80U40 1072 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Doc2gQ9ESN1 387 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifi206G3UZV2 921 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Matn1P51942 500 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hoxb13P70321 286 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt26Q3TRJ4 462 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Marveld2Q3UZP0 555 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Has1Q61647 583 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gba2Q69ZF3 918 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abhd10Q6PE15 297 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Echs1Q8BH95 290 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snx15Q91WE1 337 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B4galt3Q91YY2 395 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Msi2Q920Q6 346 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CabyrQ9D424 453 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubb3Q9ERD7 450 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CstaP56567 97 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf157Q3TEL6 685 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B3gnt3Q5JCS9 372 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itih3Q61704 889 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr60Q8C761 999 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scara3Q8C850 606 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhb2Q91Y00 799 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Necab2Q91ZP9 389 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp2b13A6H6J2 491 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Osbpl8B9EJ86 889 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 C1qbpO35658 278 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r1O70410 912 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Amer2Q8CCJ4 672 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slamf8Q9D3G2 278 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tomm20lQ9D4V6 152 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmbim4Q9DA39 238 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ptchd4B9EKX1 904 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Meaf6Q2VPQ9 191 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fnip2Q80TD3 1108 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acad10Q8K370 1069 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tsga13Q9DA17 273 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc8a3S4R2P9 928 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp358E9Q8M1 571 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcsk1P63239 753 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf148Q61624 794 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mbtps2Q8CHX6 515 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CtsqQ91ZF4 343 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PigqQ9QYT7 581 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bmp15Q9Z0L4 392 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpinb2P12388 415 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Als2clQ60I26 952 aa26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.5 ms