RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637266.2

SCN2A-215, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,610 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 HPS4Q9NQG7 708 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 VPS45Q9NRW7 570 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 LARGE1O95461 756 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 NFYCQ13952 458 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CD101Q93033 1021 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FAIM2Q9BWQ8 316 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 MYPNQ86TC9 1320 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TEX33O43247 280 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 SERPINF2P08697 491 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CSH1P0DML2 217 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CSH2P0DML3 217 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 DGKAP23743 735 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 SNX7Q9UNH6 387 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 H0YC42 278 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 GRIN3BO60391 1043 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 MYBL2P10244 700 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ADSSP30520 456 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 GTF2A2P52657 109 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CDH18Q13634 790 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF846Q147U1 533 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 PKN1Q16512 942 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 SUSD4Q5VX71 490 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 PROX1Q92786 737 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 RNFT2Q96EX2 444 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 PLK2Q9NYY3 685 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CDH9Q9ULB4 789 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 DERAQ9Y315 318 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 C21orf59P57076 290 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 NME3Q13232 169 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FNIP2Q9P278 1114 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TEX46H3BTG2 121 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 NCK2O43639 380 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 GLI1P08151 1106 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FOXO4P98177 505 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CYP24A1Q07973 514 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 MFSD5Q6N075 450 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 BORCS5Q969J3 196 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TIFAQ96CG3 184 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 PIDD1Q9HB75 910 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 URADA6NGE7 173 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 UGT2B11O75310 529 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 ITGAVP06756 1048 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 SERPINA6P08185 405 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 OR56A5P0C7T3 313 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 TXNP10599 105 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 FBLN1P23142 703 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 PON1P27169 355 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 XKRXQ6PP77 449 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-215ENST00000637266 WRNIP1Q96S55 665 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.4 ms