RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 AK5Q9Y6K8 562 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SAMD9Q5K651 1589 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SLC16A4O15374 487 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TGDSO95455 350 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NR2F6P10588 404 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GPR15P49685 360 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ARFIP1P53367 373 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TWF1Q12792 350 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ACAP2Q15057 778 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WZ62 844 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OR6A2O95222 327 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GSTT2BP0CG30 244 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PSMB9P28065 219 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CD151P48509 253 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 AIF1P55008 147 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 IL5RAQ01344 420 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC38Q5VT99 294 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CD101Q93033 1021 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LENG9Q96B70 501 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TMCO6Q96DC7 493 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 KCND1Q9NSA2 647 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HEY2Q9UBP5 337 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 H7C1W4 665 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 UGT2B11O75310 529 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 KLHL18O94889 574 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FGRP09769 529 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RPA1P27694 616 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TRAF2Q12933 501 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TTLL6Q8N841 843 aa6.5□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SMCO3A2RU48 225 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SSNA1O43805 119 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OR56A5P0C7T3 313 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ETS1P14921 441 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ADORA2BP29275 332 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 AXLP30530 894 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MTTPP55157 894 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PTPROQ16827 1216 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 IFNEQ86WN2 208 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PIK3R3Q92569 461 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PQ67 120 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 H3BNH8 94 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MAGEC1O60732 1142 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 A1BGP04217 495 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PCNAP12004 261 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HTR7P34969 479 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ALDH3A2P51648 485 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RHAGQ02094 409 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 KLHL26Q53HC5 615 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RPTNQ6XPR3 784 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 AKAP14Q86UN6 197 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HM13Q8TCT9 377 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 LY9Q9HBG7 655 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 VPS45Q9NRW7 570 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ALG6Q9Y672 507 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ATP6V1G2O95670 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NFICP08651 508 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ATP6V1B1P15313 513 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TXNRD1Q16881 649 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SCAIQ8N9R8 606 aa6.49□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.49□□□□□ -1.37
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