RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TBL1XO60907 577 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RFPL3O75679 317 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPKBP27987 946 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SGSHP51688 502 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ADIGQ0VDE8 80 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PM20D1Q6GTS8 502 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 HESX1Q9UBX0 185 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 KNL1Q8NG31 2342 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 NUMA1Q14980 2115 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPC4 97 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 LATS1O95835 1130 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL13P26373 211 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CD70P32970 193 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC3Q13217 504 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 BSPRYQ5W0U4 402 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RFWD3Q6PCD5 774 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 BHLHA9Q7RTU4 235 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC5Q8TCV5 224 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA4DQ92854 862 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TATDN2Q93075 761 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ORAI3Q9BRQ5 295 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 STIM2Q9P246 746 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MXI1P50539 228 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 NCEH1Q6PIU2 408 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 USP30Q70CQ3 517 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A7Q92504 469 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 STOML2Q9UJZ1 356 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN16Q9UKR8 245 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SCML1Q9UN30 329 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CD19P15391 556 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM9Q13443 819 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MFN1Q8IWA4 741 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL13Q8NEE6 735 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ASXL3Q9C0F0 2248 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PP55 124 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC72A6NJI9 287 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 YJEFN3A6XGL0 299 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 E7ENQ6 273 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP8O43159 456 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SIN3BO75182 1162 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 F13A1P00488 732 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 C7P10643 843 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2H1P32780 548 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 GALCP54803 685 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 BST2Q10589 180 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 NFIL3Q16649 462 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SGO2Q562F6 1265 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EID2Q8N6I1 236 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 FAXDC2Q96IV6 333 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OMDQ99983 421 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 GDF3Q9NR23 364 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC13Q9NSE7 274 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB20Q9NX57 234 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SERGEFQ9UGK8 458 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP45Q9UL16 551 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 MID1O15344 667 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PFKFB1P16118 471 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC11A2P49281 568 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ENPEPQ07075 957 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HES3Q5TGS1 186 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 UBA3Q8TBC4 463 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM131Q92545 1883 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GVL5 298 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 YKT6O15498 198 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT1P04628 370 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL1P05976 194 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK4P11802 303 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 LCP1P13796 627 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CD38P28907 300 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CST6Q15828 149 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3R6Q5UE93 754 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T34Q8NGX1 318 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 NEUROG2Q9H2A3 272 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 USP25Q9UHP3 1055 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 STX10O60499 249 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 C1SP09871 688 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CSKP41240 450 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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