RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 RNF34Q969K3 372 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 CD248Q9HCU0 757 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 COX16Q9P0S2 106 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 DOCK4Q8N1I0 1966 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 FAM170AA1A519 330 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA8SH3BPF8 625 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 F9P00740 461 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 NSFP46459 744 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 CXCR3P49682 368 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 PTP4A2Q12974 167 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 FIGNQ5HY92 759 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 CHSY1Q86X52 802 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 MFN1Q8IWA4 741 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 LGI2Q8N0V4 545 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 FIBINQ8TAL6 211 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 WFDC5Q8TCV5 224 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 PIGVQ9NUD9 493 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 ABCB8Q9NUT2 735 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 NCDNQ9UBB6 729 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 GGA2Q9UJY4 613 aa25.77■■□□□ 1.72
PMS1-220ENST00000618056 GON4LQ3T8J9 2241 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CEP250Q9BV73 2442 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 NUP205Q92621 2012 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 F5H5T6 163 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 WASP42768 502 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 SULT1E1P49888 294 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 BRMS1LQ5PSV4 323 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 TRNP1Q6NT89 227 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 BNIPLQ7Z465 357 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 AHI1Q8N157 1196 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 LMLNQ96KR4 655 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 SYT11Q9BT88 431 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 TPSD1Q9BZJ3 242 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CIPCQ9C0C6 399 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 STIM2Q9P246 746 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 STON1Q9Y6Q2 735 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 LRRC53A6NM62 1247 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 UBASH3AP57075 661 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 LPAL2Q16609 132 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 ADIPOR2Q86V24 386 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 HMGB4Q8WW32 186 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 TBCBQ99426 244 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 GMEB2Q9UKD1 530 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CEP192Q8TEP8 1941 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 PBX1P40424 430 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CHST9Q7L1S5 443 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CFAP52Q8N1V2 620 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 HINFPQ9BQA5 517 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 WASH3PC4AMC7 463 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CALB1P05937 261 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 RETP07949 1114 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 GABRG2P18507 467 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CD70P32970 193 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 IL12RB1P42701 662 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 DEUP1Q05D60 604 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 ZNF234Q14588 700 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1211LQ6NV74 962 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 C11orf74Q86VG3 221 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 DCLK2Q8N568 766 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 NUP58Q9BVL2 599 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 WDCPQ9H6R7 721 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 PAGE1O75459 146 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 PRKCIP41743 596 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 LMAN2Q12907 356 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CDH18Q13634 790 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 RABGAP1LQ5R372 815 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 FBXL22Q6P050 247 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 MON1BQ7L1V2 547 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 KBTBD6Q86V97 674 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 SORCS1Q8WY21 1168 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 LOXL4Q96JB6 756 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 CFAP57Q96MR6 1250 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-220ENST00000618056 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.72■■□□□ 1.71
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