RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 COL26A1Q96A83 441 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TMX3Q96JJ7 454 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CLIC6Q96NY7 704 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BBS2Q9BXC9 721 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PANK4Q9NVE7 773 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 IL37Q9NZH6 218 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 A0A087X0B3 334 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GTW7 788 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FAM92AA1XBS5 289 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 KCNJ18B7U540 433 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CILPO75339 1184 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TBX18O95935 607 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CISD3P0C7P0 127 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NCAM1P13591 858 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CD6P30203 668 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MYL6P60660 151 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SURF1Q15526 300 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FUT11Q495W5 492 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 LCE3BQ5TA77 95 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SDE2Q6IQ49 451 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 HTR3DQ70Z44 454 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GPR174Q9BXC1 333 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GAREM1Q9H706 876 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DKK4Q9UBT3 224 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CLIC4Q9Y696 253 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.24□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GFRA2O00451 464 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GSC2O15499 205 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TLR5O60602 858 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BEST1O76090 585 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PRB1P04280 392 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FAM163BP0C2L3 166 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ZNF883P0CG24 379 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TNNI1P19237 187 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CDH8P55286 799 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TNNC1P63316 161 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CYP4F3Q08477 520 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BRAPQ7Z569 592 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CGRRF1Q99675 332 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SMOQ99835 787 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MED10Q9BTT4 135 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PANK2Q9BZ23 570 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NACA2Q9H009 215 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SDCBP2Q9H190 292 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 KRT82Q9NSB4 513 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 OSER1Q9NX31 292 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PLK2Q9NYY3 685 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.23□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BPTFQ12830 3046 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NUMA1Q14980 2115 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GVT2 93 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FAM149AA5PLN7 773 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 METTL12A8MUP2 240 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MDM4O15151 490 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TGFB1I1O43294 461 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CER1O95813 267 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GLB1P16278 677 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MATKP42679 507 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 IL12RB1P42701 662 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CYP24A1Q07973 514 aa9.22□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PSMD6Q15008 389 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms