RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	E2F5	Q15329	346 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	TAF3	Q5VWG9	929 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM215	Q68D42	235 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF34	Q969K3	372 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	AZIN2	Q96A70	460 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC39A13	Q96H72	371 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD93	Q9NPY3	652 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANO10	Q9NW15	660 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	FANCL	Q9NW38	375 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	GGA2	Q9UJY4	613 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-233	ENST00000591989	PATE3	B3GLJ2	98 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	GIPC1	O14908	333 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	NPC1	O15118	1278 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	IRAK2	O43187	625 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	NDUFS2	O75306	463 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF217	O75362	1048 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERBB2	P04626	1255 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	HLA-E	P13747	358 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	UCHL3	P15374	230 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP11B1	P15538	503 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKCH	P24723	683 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD70	P32970	193 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTGER3	P43115	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLK7	P49862	253 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNX16	P57768	344 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDK17	Q00537	523 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRT31	Q15323	416 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	FUT11	Q495W5	492 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBLAC2	Q68D91	279 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	BEND5	Q7L4P6	421 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CACUL1	Q86Y37	369 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	MFN1	Q8IWA4	741 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	LGI2	Q8N0V4	545 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	AHI1	Q8N157	1196 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36	4e-8	■■■□□ 17
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989		H0Y626	953 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	AP5Z1	O43299	807 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	HSF2BP	O75031	334 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBD3	O95983	291 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC6A3	Q01959	620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	NME3	Q13232	169 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	NNT	Q13423	1086 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDH18	Q13634	790 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	STX1A	Q16623	288 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	MPP7	Q5T2T1	576 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF43	Q68DV7	783 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHSY1	Q86X52	802 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF366	Q8N895	744 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36

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