RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 INSL6Q9Y581 213 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 M0R3H8 397 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 CDKL5O76039 1030 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MATN4O95460 622 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 GH1P01241 217 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PTPN7P35236 360 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 KIR2DL3P43628 341 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PIK3CGP48736 1102 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 LY6KQ17RY6 165 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 TCTN1Q2MV58 587 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 KAT2BQ92831 832 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MED16Q9Y2X0 877 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 EMSYQ7Z589 1322 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 STK36Q9NRP7 1315 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ESYT2A0FGR8 921 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 AMHP03971 560 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 GYPEP15421 78 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 NLRP5P59047 1200 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP1Q07960 439 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PPFIA1Q13136 1202 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PCOLCEQ15113 449 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 NPY5RQ15761 445 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 KCNMB1Q16558 191 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 C18orf8Q96DM3 657 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 IQCDQ96DY2 449 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 C6orf50Q9HD87 102 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SERHLQ9NQF3 203 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MYO7AQ13402 2215 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 TECTAO75443 2155 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 BTN3A1O00481 513 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF286BP0CG31 522 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SP2Q02086 613 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 DUSP2Q05923 314 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 EPC2Q52LR7 807 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PRR31Q5SQ13 230 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 PPTC7Q8NI37 304 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MDM1Q8TC05 714 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 MZB1Q8WU39 189 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SNX22Q96L94 193 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 YME1L1Q96TA2 773 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4D-210ENST00000588972 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.4□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CACNA1AO00555 2505 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 H3BNC9 293 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MTSS1O43312 755 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TBC1D4O60343 1298 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GGPS1O95749 300 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 192.6 ms