RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 RNF43Q68DV7 783 aa27.03■■□□□ 1.92
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NME3-209ENST00000566600 P2RY11Q96G91 374 aa27.03■■□□□ 1.92
NME3-209ENST00000566600 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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NME3-209ENST00000566600 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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NME3-209ENST00000566600 RNF40O75150 1001 aa27.02■■□□□ 1.92
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NME3-209ENST00000566600 HDAC4P56524 1084 aa27.02■■□□□ 1.92
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NME3-209ENST00000566600 KCNV2Q8TDN2 545 aa27.02■■□□□ 1.92
NME3-209ENST00000566600 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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NME3-209ENST00000566600 RPS24P62847 133 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 MESP2Q0VG99 397 aa27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 MTAPQ13126 283 aa27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 C10orf76Q5T2E6 689 aa27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 FBXL22Q6P050 247 aa27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 LRRC31Q6UY01 552 aa27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 H2AFVQ71UI9 128 aa27.01■■□□□ 1.91
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NME3-209ENST00000566600 C1orf210Q8IVY1 113 aa27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 NTAN1Q96AB6 310 aa27.01■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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NME3-209ENST00000566600 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa27■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 TRIM24O15164 1050 aa27■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 AIF1P55008 147 aa27■■□□□ 1.91
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NME3-209ENST00000566600 Q6ZS52 159 aa27■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 MFN1Q8IWA4 741 aa27■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 CCDC170Q8IYT3 715 aa27■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 CFAP52Q8N1V2 620 aa27■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 NUP85Q9BW27 656 aa27■■□□□ 1.91
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NME3-209ENST00000566600 SPTLC3Q9NUV7 552 aa27■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 VANGL2Q9ULK5 521 aa27■■□□□ 1.91
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NME3-209ENST00000566600 ACAP1Q15027 740 aa26.99■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 C5orf22Q49AR2 442 aa26.99■■□□□ 1.91
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NME3-209ENST00000566600 MYEOVQ96EZ4 313 aa26.99■■□□□ 1.91
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NME3-209ENST00000566600 UCMAQ8WVF2 138 aa26.97■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 ARHGEF26Q96DR7 871 aa26.97■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa26.97■■□□□ 1.91
NME3-209ENST00000566600 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa26.97■■□□□ 1.91
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