RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	GBE1	Q04446	702 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	UBE3A	Q05086	875 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	KCNJ11	Q14654	390 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PSMD5	Q16401	504 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	MYLPF	Q96A32	169 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279		E7EVH7	732 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	KCNN4	O15554	427 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	LILRB3	O75022	631 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CDH16	O75309	829 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ZBED1	O96006	694 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ATP5D	P30049	168 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	GPX6	P59796	221 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PKMYT1	Q99640	499 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ACBD6	Q9BR61	282 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PAK5	Q9P286	719 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	GMNC	A6NCL1	334 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279		E7ENQ6	273 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279		M0QYT0	321 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	FAM107A	O95990	144 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CREB1	P16220	341 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	GOT1	P17174	413 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	AMPD1	P23109	780 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	OR1D2	P34982	312 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	HYAL1	Q12794	435 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	XRCC4	Q13426	336 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	METTL23	Q86XA0	190 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	10.47	□□□□□ -0.73	9e-9	■■■■□ 19.8
TCF4-231	ENST00000566279	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PIGV	Q9NUD9	493 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	SYN3	O14994	580 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	CHAD	O15335	359 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	EPCAM	P16422	314 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	NR2C2	P49116	596 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	TDRP	Q86YL5	185 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	MAML1	Q92585	1016 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	APOL5	Q9BWW9	433 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	TLE6	Q9H808	572 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.46	□□□□□ -0.73

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