RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564584.1

CTU2-205, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 896 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-205ENST00000564584 CRY1Q16526 586 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 RNF43Q68DV7 783 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 ANO7Q6IWH7 933 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 RASSF3Q86WH2 238 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TMEM139Q8IV31 216 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TCEAL3Q969E4 200 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 NMUR1Q9HB89 426 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 A0A0A0MRY4 1105 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 E2F8A0AVK6 867 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 ADH1CP00326 375 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 RRM1P23921 792 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MATKP42679 507 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MAGEA1P43355 309 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 GALCP54803 685 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 COG7P83436 770 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MTA1Q13330 715 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 NNTQ13423 1086 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 COCHO43405 550 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ALDH1A2O94788 518 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KAT7O95251 611 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KCNK5O95279 499 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 F9P00740 461 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 APODP05090 189 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CYP1A2P05177 515 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ABCB4P21439 1286 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SDC4P31431 198 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 GRIA2P42262 883 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MESP2Q0VG99 397 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MAMLD1Q13495 774 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ACAP1Q15027 740 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 DCAF6Q58WW2 860 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PMS2CLQ68D20 193 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 DEFB106AQ8N104 65 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ALLCQ8N6M5 410 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SERPINB11Q96P15 392 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 OSER1Q9NX31 292 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 C4orf47A7E2U8 309 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SLC2A3P11169 496 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ADH5P11766 374 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PDGFRAP16234 1089 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PMLP29590 882 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TIE1P35590 1138 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PTPN9P43378 593 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TNFRSF4P43489 277 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 GAD2Q05329 585 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 EFEMP1Q12805 493 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 C2CD6Q53TS8 623 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 EOGTQ5NDL2 527 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 EMC10Q5UCC4 262 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 C12orf40Q86WS4 652 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms