RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	GSR	P00390	522 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA2B	P08514	1039 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	KCNE1	P15382	129 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MGAT1	P26572	445 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	KLC1	Q07866	573 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF6	Q58WW2	860 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP16	Q9BY84	665 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RAD54B	Q9Y620	910 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NRCAM	Q92823	1304 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559		A6NHS1	94 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	HCRT	O43612	131 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINE1	P05121	402 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SMPD1	P17405	629 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CPA2	P48052	419 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SLC1A6	P48664	564 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	KDSR	Q06136	332 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ANO7	Q6IWH7	933 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PIGZ	Q86VD9	579 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SPDL1	Q96EA4	605 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PLXNB2	O15031	1838 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TBX10	O75333	385 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MYL4	P12829	197 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	GP5	P40197	560 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	AIF1	P55008	147 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ADIG	Q0VDE8	80 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	GRTP1	Q5TC63	336 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CCNY	Q8ND76	341 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PGBD4	Q96DM1	585 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	OSMR	Q99650	979 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE1	Q99829	537 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	EMCN	Q9ULC0	261 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SBF1	O95248	1867 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SPTLC1	O15269	473 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MX2	P20592	715 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP5	P24588	427 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	IRX4	P78413	519 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CRADD	P78560	199 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	XKR4	Q5GH76	650 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	BNIPL	Q7Z465	357 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DPP9	Q86TI2	863 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NME8	Q8N427	588 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9A7	Q96T83	725 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NPY6R	Q99463	290 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	APOL6	Q9BWW8	343 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FAM163B	P0C2L3	166 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NPR3	P17342	541 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB4	P28070	264 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CDC25C	P30307	473 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CDK7	P50613	346 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MXRA7	P84157	204 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	IRGC	Q6NXR0	463 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RASSF3	Q86WH2	238 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SOX13	Q9UN79	622 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	UNCX	A6NJT0	531 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NCAM2	O15394	837 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K7	O43318	606 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PAX7	P23759	505 aa		18.89	■□□□□ 0.62

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