RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558961.1

BMP4-204, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-204ENST00000558961 KLK7P49862 253 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 NOMO3P69849 1222 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 MTA1Q13330 715 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 ZNF234Q14588 700 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 DCAF6Q58WW2 860 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 ZNF677Q86XU0 584 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 DEFB106AQ8N104 65 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 AHI1Q8N157 1196 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 FIBINQ8TAL6 211 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 NT5C3BQ969T7 300 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 MYEOVQ96EZ4 313 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 TMEM245Q9H330 911 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 ABCB8Q9NUT2 735 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 CACNA1AO00555 2505 aa11.65□□□□□ -0.54
BMP4-204ENST00000558961 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 WASH3PC4AMC7 463 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 TBL1XO60907 577 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 ZNF217O75362 1048 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 SLC2A3P11169 496 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 GBP1P32455 592 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 NOS2P35228 1153 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 SOX5P35711 763 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 MATKP42679 507 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 LIMK1P53667 647 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 CDK17Q00537 523 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 SLC6A3Q01959 620 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 ARID5BQ14865 1188 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 SYCP1Q15431 976 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 FUT11Q495W5 492 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 ARCQ7LC44 396 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 SPC24Q8NBT2 197 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 NETO1Q8TDF5 533 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 RLN3Q8WXF3 142 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 NPY6RQ99463 290 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 CIPCQ9C0C6 399 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 VPS45Q9NRW7 570 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 DDIT4Q9NX09 232 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 RRN3Q9NYV6 651 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 INVSQ9Y283 1065 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 RAD54BQ9Y620 910 aa11.64□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 IGLV3-19P01714 112 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 MMEP08473 750 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 FECHP22830 423 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 PRKCHP24723 683 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 CCR1P32246 355 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 CD70P32970 193 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 COPAP53621 1224 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 GSDMDP57764 484 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 STARD3Q14849 445 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 PTPRNQ16849 979 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 CHST9Q7L1S5 443 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 TMC6Q7Z403 805 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 BNIPLQ7Z465 357 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 XYLT1Q86Y38 959 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 MFN1Q8IWA4 741 aa11.63□□□□□ -0.55
BMP4-204ENST00000558961 FRMD1Q8N878 549 aa11.63□□□□□ -0.55
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