RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558341.5

PSMA4-206, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 5 BASIC

Gene PSMA4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-206	ENST00000558341	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA4-206	ENST00000558341	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA4-206	ENST00000558341	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA4-206	ENST00000558341	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA4-206	ENST00000558341	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA4-206	ENST00000558341	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA4-206	ENST00000558341	PPEF2	O14830	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	MOSPD3	O75425	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ACTL6B	O94805	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	LARGE1	O95461	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CYP3A4	P08684	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	AKR1A1	P14550	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	IGFBP2	P18065	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	GRK5	P34947	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CPA2	P48052	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	RABEP1	Q15276	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CNTN5	O94779	1100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SGPL1	O95470	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	FGB	P02675	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CYP3A7	P24462	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	POLE2	P56282	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	AP2B1	P63010	937 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SHC2	P98077	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	FOXO1	Q12778	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	USP12	O75317	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TFEB	P19484	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	LMO1	P25800	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	CDK7	P50613	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	KAT2B	Q92831	832 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	UGDH	O60701	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA4-206	ENST00000558341	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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