RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	F5	P12259	2224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994		M0QZQ0	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SYN3	O14994	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP2C2	O75185	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SOAT2	O75908	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SEC24A	O95486	1093 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	KRT10	P13645	584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CNR2	P34972	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	EPHB3	P54753	998 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CDH8	P55286	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM193A	P78312	1265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NFKB2	Q00653	900 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TSPY1	Q01534	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PFKP	Q01813	784 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CREB5	Q02930	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LRMP	Q12912	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DUSP4	Q13115	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RAB33A	Q14088	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994		Q6ZS52	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NELL2	Q99435	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DSE	Q9UL01	958 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994		A8MXQ7	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HCRT	O43612	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	STX10	O60499	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ICMT	O60725	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms