RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CD93	Q9NPY3	652 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	USP18	Q9UMW8	372 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996		I6L893	689 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TACR2	P21452	398 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NOS2	P35228	1153 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	FLT3	P36888	993 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SCNN1A	P37088	669 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MATK	P42679	507 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NME3	Q13232	169 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PTPRN	Q16849	979 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	FUT11	Q495W5	492 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	FSCB	Q5H9T9	825 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PMS2CL	Q68D20	193 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SDE2	Q6IQ49	451 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CHSY1	Q86X52	802 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NT5C3B	Q969T7	300 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PIGV	Q9NUD9	493 aa		21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	21.62	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SMTNL1	A8MU46	457 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996		M0QYT0	321 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	LRP3	O75074	770 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CCR1	P32246	355 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	GBP1	P32455	592 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ARID5A	Q03989	594 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	LMAN2	Q12907	356 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MFN1	Q8IWA4	741 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PGBD3	Q8N328	593 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	UCMA	Q8WVF2	138 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	RMDN1	Q96DB5	314 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CBX8	Q9HC52	389 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		21.61	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NPC1	O15118	1278 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TIMM44	O43615	452 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	HLA-E	P13747	358 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MMP8	P22894	467 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	GGCX	P38435	758 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	IRAK1	P51617	712 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PTP4A2	Q12974	167 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ELF2	Q15723	593 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MBLAC2	Q68D91	279 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	AHI1	Q8N157	1196 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	BAP1	Q92560	729 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TBCB	Q99426	244 aa		21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SPTBN2	O15020	2390 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GTH6	734 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ADCY5	O95622	1261 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SLC2A3	P11169	496 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SULT1E1	P49888	294 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CSRP2	Q16527	193 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	FBXL22	Q6P050	247 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	BNIPL	Q7Z465	357 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	LUZP1	Q86V48	1076 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ZNF366	Q8N895	744 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	RNF34	Q969K3	372 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	IGSF8	Q969P0	613 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TMEM245	Q9H330	911 aa		21.59	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996		F5H5T6	163 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PAGE1	O75459	146 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	RHOBTB1	O94844	696 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	GJB6	O95452	261 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ABCB4	P21439	1286 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MPL	P40238	635 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CXCR3	P49682	368 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	COPA	P53621	1224 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CENPC	Q03188	943 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CDH18	Q13634	790 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ARTN	Q5T4W7	220 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		21.58	■■□□□ 1.05

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