RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	RHO	P08100	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SRGN	P10124	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	XBP1	P17861	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PTGS2	P35354	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PRKAA2	P54646	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	HAS1	Q92839	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	COG8	Q96MW5	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	MAF1	Q9H063	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CEP72	Q9P209	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089		B9A039	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089		E7EVH7	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CES2	O00748	559 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	YY2	O15391	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SUV39H1	O43463	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	NXPH3	O95157	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CER1	O95813	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ONECUT2	O95948	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ERBB2	P04626	1255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	POLB	P06746	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	NR4A1	P22736	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PBX1	P40424	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67	2e-8	■□□□□ 9.8
MDM2-223	ENST00000536089	TPTE	P56180	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ACTR2	P61160	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PIGB	Q92521	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	VPS16	Q9H269	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TJP1	Q07157	1748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	FYB1	O15117	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	FAM155B	O75949	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LARGE1	O95461	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PRKCB	P05771	671 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	C1S	P09871	688 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	NR2F6	P10588	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CKMT1A	P12532	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CREB1	P16220	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SERPINA4	P29622	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	COL15A1	P39059	1388 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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