RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM72BQ86X60 149 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRD1A4D1F6 860 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 E9PAM4 449 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT1P04264 644 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PRLRP16471 622 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMC3P17980 439 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 TACR2P21452 398 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 IL4RP24394 825 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC6A4P31645 630 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 DPYSL3Q14195 570 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL22Q6P050 247 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC31Q6UY01 552 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CHSY1Q86X52 802 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 FAF2Q96CS3 445 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAI1Q9UI46 699 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 NEU3Q9UQ49 428 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 DRGXA6NNA5 263 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 F5H5T6 163 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN7P35236 360 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 ARL4AP40617 200 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT81Q14533 505 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 ODF2Q5BJF6 829 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 MPP7Q5T2T1 576 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC16Q8NEE8 873 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX12Q9UMY4 172 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 H3BRJ5 948 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CES2O00748 559 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CD48P09326 243 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PYGMP11217 842 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 IL9P15248 144 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CDKN2BP42772 138 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PDGFRLQ15198 375 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP2R5EQ16537 467 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 C14orf80Q86SX3 495 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CALN1Q9BXU9 219 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNK3O14649 394 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CHADO15335 359 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CASQ1P31415 396 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 GGCXP38435 758 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 CETN2P41208 172 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 EML3Q32P44 896 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF43Q68DV7 783 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 RFX8Q6ZV50 586 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 KXD1Q9BQD3 176 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-205ENST00000528462 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CREB3O43889 395 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 GOT1P17174 413 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 IFNAR2P48551 515 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TPI1P60174 286 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DPYSQ14117 519 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 LGI2Q8N0V4 545 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP2A3Q93084 1043 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ASIC4Q96FT7 647 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 PBKQ96KB5 322 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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