RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-215	ENST00000506510	CNGA3	Q16281	694 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	KRT73	Q86Y46	540 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	TTC14	Q96N46	770 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	TM2D2	Q9BX73	214 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CERS4	Q9HA82	394 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PDP2	Q9P2J9	529 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CDC23	Q9UJX2	597 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	BMP15	O95972	392 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PYGL	P06737	847 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CAPN3	P20807	821 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	GSTM5	P46439	218 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	VPS41	P49754	854 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PLCD1	P51178	756 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SEMA3B	Q13214	749 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	OR8H2	Q8N162	312 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	NRAC	Q8N912	160 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CEP83	Q9Y592	693 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510		K7ENM7	598 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PRY	O14603	147 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PLAU	P00749	431 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ABCB4	P21439	1286 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MATN1	P21941	496 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	NDUFS1	P28331	727 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	DUSP1	P28562	367 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	NR4A2	P43354	598 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MPP1	Q00013	466 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MPEG1	Q2M385	716 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ARMC3	Q5W041	872 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ZNF366	Q8N895	744 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PIGK	Q92643	395 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510		A0A087WV62	115 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510		J3KTA2	159 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510		M0QZQ0	153 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SOCS2	O14508	198 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CTSA	P10619	480 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PRF1	P14222	555 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ST6GAL1	P15907	406 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MMP8	P22894	467 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	IDUA	P35475	653 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	HSPA7	P48741	367 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	HSF1	Q00613	529 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PRKG2	Q13237	762 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	BLMH	Q13867	455 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	CCDC38	Q502W7	563 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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