RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504292.1

ABCE1-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 3

Gene ABCE1, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-204	ENST00000504292	RABEP1	Q15276	862 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	AWAT1	Q58HT5	328 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	KRT73	Q86Y46	540 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	ZBTB9	Q96C00	473 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GCC1	Q96CN9	775 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	PCNT	O95613	3336 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	COL15A1	P39059	1388 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292		H3BNC9	293 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MGEA5	O60502	916 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	RNF8	O76064	485 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	INMT	O95050	263 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	STARD3NL	O95772	234 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	TPH1	P17752	444 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	PEX2	P28328	305 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MAP2K2	P36507	400 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	PLCD1	P51178	756 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM193A	P78312	1265 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	LAMB3	Q13751	1172 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GBX1	Q14549	363 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GRM3	Q14832	879 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	CNBD1	Q8NA66	436 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	DKK4	Q9UBT3	224 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292		A8MVJ9	347 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	VSTM5	A8MXK1	200 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MCM5	P33992	734 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	NR4A2	P43354	598 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	COQ8B	Q96D53	544 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	HMCES	Q96FZ2	354 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MASTL	Q96GX5	879 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	CD19	P15391	556 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GHRHR	Q02643	423 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	CFHR3	Q02985	330 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	KCNB1	Q14721	858 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	SEC23B	Q15437	767 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	ST3GAL2	Q16842	350 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	USP49	Q70CQ1	688 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	UNC13D	Q70J99	1090 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GPC2	Q8N158	579 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	MAP4K1	Q92918	833 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	CUL5	Q93034	780 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	VPS51	Q9UID3	782 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCE1-204	ENST00000504292	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	ADAM10	O14672	748 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	FGB	P02675	491 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	NTSR1	P30989	418 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	SHC4	Q6S5L8	630 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	VSTM1	Q6UX27	236 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ABCE1-204	ENST00000504292	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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