RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CIPCQ9C0C6 399 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ACAD9Q9H845 621 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GRM8O00222 908 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 WEE2P0C1S8 567 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 PEPDP12955 493 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN3P20807 821 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ADRA1BP35368 520 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CDK18Q07002 472 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 LCE3BQ5TA77 95 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MMS19Q96T76 1030 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 HSF4Q9ULV5 492 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 H3BNC9 293 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 FYB1O15117 783 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 TULP3O75386 442 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 TBX18O95935 607 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MT-CO3P00414 261 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GPD2P43304 727 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 AGTR2P50052 363 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SPRED1Q7Z699 444 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MASTLQ96GX5 879 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 C7orf26Q96N11 449 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CLPBQ9H078 707 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087X0M5 115 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GX30 115 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ADH4P08319 380 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 DRD4P21917 467 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCHP24723 683 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 NFIL3Q16649 462 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CEP85Q6P2H3 762 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 UCMAQ8WVF2 138 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 KAZALD1Q96I82 304 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 APOPT1Q96IL0 206 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 FUZQ9BT04 418 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 THAP1Q9NVV9 213 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CLIC1O00299 241 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC3O60645 756 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM63AO94886 807 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 METTL18O95568 372 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ELFN1P0C7U0 828 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD12P35452 270 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT2Q10471 571 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 FOXI1Q12951 378 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK1Q14012 370 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 VSTM1Q6UX27 236 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HIC2Q96JB3 615 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CD180Q99467 661 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM2Q9C040 744 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CD207Q9UJ71 328 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD19C9JJ37 291 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN4O14817 238 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFS1P28331 727 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 MCM7P33993 719 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PAFAH1B1P43034 410 aa8.45□□□□□ -1.06
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