RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476646.5

NFIA-209, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 3

Gene NFIA, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-209	ENST00000476646	ALOX15B	O15296	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	TM9SF1	O15321	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	OIP5	O43482	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	GRAP2	O75791	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CABYR	O75952	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	GJB6	O95452	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SHBG	P04278	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	EDN1	P05305	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	GHR	P10912	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	AKAP5	P24588	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CNTF	P26441	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	KLRC2	P26717	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	GPD2	P43304	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	LIG3	P49916	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SEC24C	P53992	1094 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CDK16	Q00536	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SNX17	Q15036	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	PIK3R2	O00459	728 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	COPE	O14579	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	GIPC1	O14908	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	5e-6	■■□□□ 13.8
NFIA-209	ENST00000476646	LPXN	O60711	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFIA-209	ENST00000476646	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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