RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.64■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.64■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PLA2G4CQ9UP65 541 aa23.64■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SPTBN2O15020 2390 aa23.64■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PI4KAP42356 2102 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 LNP1A1A4G5 178 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SLC2A3P11169 496 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CYP11B1P15538 503 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CD70P32970 193 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 HOXD12P35452 270 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 KRT31Q15323 416 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 MBLAC2Q68D91 279 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CHSY1Q86X52 802 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 FIBINQ8TAL6 211 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 VPS16Q9H269 839 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 DDIT4Q9NX09 232 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 F8VZ95 297 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 DAB1O75553 588 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CDH18Q13634 790 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SIPA1Q96FS4 1042 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 STK33Q9BYT3 514 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TMEM245Q9H330 911 aa23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PATE3B3GLJ2 98 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 NDUFS2O75306 463 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 GRAP2O75791 330 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TACR2P21452 398 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CCR1P32246 355 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 COPAP53621 1224 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SLC6A3Q01959 620 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 MYL5Q02045 173 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ZNF33AQ06730 810 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 LGI2Q8N0V4 545 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 LMLNQ96KR4 655 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 GANQ9H2C0 597 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CD93Q9NPY3 652 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 FANCLQ9NW38 375 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PILRBQ9UKJ0 227 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 NCOR2Q9Y618 2525 aa23.61■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 F5H5T6 163 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 HLA-EP13747 358 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ABCB4P21439 1286 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ITPKAP23677 461 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CD6P30203 668 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 LMAN2Q12907 356 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 MTA1Q13330 715 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PTPRNQ16849 979 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TRIM61Q5EBN2 209 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TAF3Q5VWG9 929 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 OR2T3Q8NH03 318 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 RNF34Q969K3 372 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 HSPA12BQ96MM6 686 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 FBRSQ9HAH7 460 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 COX16Q9P0S2 106 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 LSM8O95777 96 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ASLP04424 464 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ACADMP11310 421 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 NOS2P35228 1153 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 PPM1JQ5JR12 505 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 RABEPKQ7Z6M1 372 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 DEFB119Q8N690 84 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms