RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PMM1	Q92871	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ICA1	Q05084	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	DMWD	Q09019	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MORC3	Q14149	939 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAR2	Q96K12	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SYT5	O00445	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ACKR2	O00590	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	NKX2-8	O15522	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ME1	P48163	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SOX2	P48431	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SLC37A1	P57057	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TAS2R50	P59544	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SHC2	P98077	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PEX14	O75381	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	NTN1	O95631	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TFEB	P19484	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SCP2	P22307	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SERPINF1	P36955	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MTX1	Q13505	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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