RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	MTA1	Q13330	715 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GEN1	Q17RS7	908 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MPP7	Q5T2T1	576 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SDE2	Q6IQ49	451 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SYT13	Q7L8C5	426 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MFN1	Q8IWA4	741 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HHIP	Q96QV1	700 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CIPC	Q9C0C6	399 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902		H0Y626	953 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GFRA2	O00451	464 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RTN2	O75298	545 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ADCY5	O95622	1261 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GZMA	P12544	262 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GPD1	P21695	349 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HOXC13	P31276	330 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GGCX	P38435	758 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	FNTB	P49356	437 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CDH18	Q13634	790 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CCDC14	Q49A88	953 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	EOGT	Q5NDL2	527 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	WDR59	Q6PJI9	974 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TMC6	Q7Z403	805 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	FAM131B	Q86XD5	332 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CHPF	Q8IZ52	775 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	UCMA	Q8WVF2	138 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MCEE	Q96PE7	176 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TMEM51	Q9NW97	253 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		18.36	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902		K7ESF4	209 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SGK1	O00141	431 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	DES	P17661	470 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	DMWD	Q09019	674 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SARM1	Q6SZW1	724 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ZNF653	Q96CK0	615 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PARVA	Q9NVD7	372 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	GGA2	Q9UJY4	613 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		18.35	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	AP5Z1	O43299	807 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HLA-F	P30511	346 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	NTSR1	P30989	418 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PTPN9	P43378	593 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	FBXL22	Q6P050	247 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CHST9	Q7L1S5	443 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	NELL1	Q92832	810 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ACOX2	Q99424	681 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		18.34	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms