RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SRLQ86TD4 932 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 TNS4Q8IZW8 715 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PDIK1LQ8N165 341 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC110Q8TBZ0 833 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FBF1Q8TES7 1133 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 HTR3CQ8WXA8 447 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SLC39A13Q96H72 371 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf48Q96LL4 319 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CASD1Q96PB1 797 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 NMUR1Q9HB89 426 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 IL21Q9HBE4 155 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SENP1Q9P0U3 644 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 GRID1Q9ULK0 1009 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF37A1IGU5 675 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM23A6NLE4 172 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 WASH4PA8MWX3 477 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD13C9JR72 458 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 RNF103O00237 685 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 DNM1LO00429 736 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAB1O14561 156 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SYN3O14994 580 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 OPHN1O60890 802 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FKTNO75072 461 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 AVILO75366 819 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K6O95382 1288 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 F9P00740 461 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV3-27P01718 113 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 BRAFP15056 766 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 DESP17661 470 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ERCC2P18074 760 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 TAC1P20366 129 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5DP30049 168 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 GRK4P32298 578 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FOXN2P32314 431 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2C18P33260 490 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 HTR7P34969 479 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FDFT1P37268 417 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ARL4AP40617 200 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CCNFP41002 786 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 GRIA1P42261 906 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ETV4P43268 484 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 NEK3P51956 506 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A3P53794 718 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS12P56730 875 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CORO7P57737 925 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SLC18A2Q05940 514 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PDK1Q15118 436 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 BBS9Q3SYG4 887 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 METTL23Q86XA0 190 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF567Q8N184 647 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MPP5Q8N3R9 675 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 BANPQ8N9N5 519 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ADAM32Q8TC27 787 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms