RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 K7EQS6 105 aa9.89□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
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PKP4-208ENST00000462335 MAP3K13O43283 966 aa9.89□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 DAPK3O43293 454 aa9.89□□□□□ -0.83
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PKP4-208ENST00000462335 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.88□□□□□ -0.83
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PKP4-208ENST00000462335 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.87□□□□□ -0.83
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