RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 TRNP1Q6NT89 227 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CHST9Q7L1S5 443 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ARCQ7LC44 396 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 GABRG3Q99928 467 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 HINFPQ9BQA5 517 aa21.47■■□□□ 1.03
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VARS-218ENST00000459667 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 NCDNQ9UBB6 729 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 USP34Q70CQ2 3546 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 NPC1O15118 1278 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 F9P00740 461 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CALB1P05937 261 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PBX1P40424 430 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CXCR3P49682 368 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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VARS-218ENST00000459667 E2F5Q15329 346 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 FIGNQ5HY92 759 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 AHI1Q8N157 1196 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 EMC1Q8N766 993 aa21.46■■□□□ 1.03
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VARS-218ENST00000459667 RUBCNQ92622 972 aa21.46■■□□□ 1.03
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VARS-218ENST00000459667 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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VARS-218ENST00000459667 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 A0A1W2PQF6 199 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 WASH3PC4AMC7 463 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 TIMM44O43615 452 aa21.45■■□□□ 1.02
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VARS-218ENST00000459667 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.45■■□□□ 1.02
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VARS-218ENST00000459667 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 MON1BQ7L1V2 547 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 FIBINQ8TAL6 211 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 SYT11Q9BT88 431 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 WDCPQ9H6R7 721 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 TMEM51Q9NW97 253 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.45■■□□□ 1.02
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VARS-218ENST00000459667 H0Y626 953 aa21.44■■□□□ 1.02
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VARS-218ENST00000459667 ADCY5O95622 1261 aa21.44■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 IL12RB1P42701 662 aa21.44■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 ZNF234Q14588 700 aa21.44■■□□□ 1.02
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VARS-218ENST00000459667 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.44■■□□□ 1.02
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VARS-218ENST00000459667 ATP11AP98196 1134 aa21.43■■□□□ 1.02
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VARS-218ENST00000459667 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 STARD3Q14849 445 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 FUT11Q495W5 492 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 MBLAC2Q68D91 279 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-218ENST00000459667 BNIPLQ7Z465 357 aa21.43■■□□□ 1.02
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