RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 JMJD7P0C870 316 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 DDIT3P35638 169 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PGM5Q15124 567 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 IGSF21Q96ID5 467 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 KXD1Q9BQD3 176 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 STAM2O75886 525 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 LRRC32Q14392 662 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ELF2Q15723 593 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MAN2A1Q16706 1144 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC142Q17RM4 750 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 GAB3Q8WWW8 586 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TCEAL3Q969E4 200 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 AZI2Q9H6S1 392 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PALB2Q86YC2 1186 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF843Q8N446 348 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 BRD9Q9H8M2 597 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 POLR2MP0CAP2 368 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CFHR1Q03591 330 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 Q6YL49 198 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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