RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 NDST2P52849 883 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 EPHA5P54756 1037 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 DYNLT1P63172 113 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CDK16Q00536 496 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MTMR3Q13615 1198 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MORF4L2Q15014 288 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ALS2CLQ60I27 953 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CROCCP2Q86T23 111 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HOOK3Q86VS8 718 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MREGQ8N565 214 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 FATE1Q969F0 183 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TSGA13Q96PP4 275 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 EPC1Q9H2F5 836 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 USP29Q9HBJ7 922 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 E9PAM4 449 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PSMD3O43242 534 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ACSL4O60488 711 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HDCP19113 662 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CCNCP24863 283 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 IVDP26440 423 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CDR1P51861 262 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A9P82251 487 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 LLGL1Q15334 1064 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ADGRF1Q5T601 910 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CFAP58Q5T655 872 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MANEALQ5VSG8 457 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RELL1Q8IUW5 271 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CNPY4Q8N129 248 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 FMO2Q99518 471 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SIK2Q9H0K1 926 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ASAH2Q9NR71 780 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 DTLQ9NZJ0 730 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 NFU1Q9UMS0 254 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SNX24Q9Y343 169 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HIDE1A8MVS5 230 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 AP3B1O00203 1094 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MAP2K7O14733 419 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 GRM6O15303 877 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 COCHO43405 550 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 OLFM2O95897 454 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TBX18O95935 607 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CA3P07451 260 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJB1P25685 340 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 WEE1P30291 646 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 FDFT1P37268 417 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ETFBP38117 255 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MAPKAPK2P49137 400 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 PGFP49763 221 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 PLTPP55058 493 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 OXCT1P55809 520 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT2Q10471 571 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms