RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420363.5

CPNE1-211, Transcript of copine 1, humanhuman

TSL 2

Gene CPNE1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1-211ENST00000420363 GABRG3Q99928 467 aa22.15■■□□□ 1.14
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CPNE1-211ENST00000420363 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.15■■□□□ 1.14
CPNE1-211ENST00000420363 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CPNE1-211ENST00000420363 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CPNE1-211ENST00000420363 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.15■■□□□ 1.14
CPNE1-211ENST00000420363 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.15■■□□□ 1.14
CPNE1-211ENST00000420363 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CPNE1-211ENST00000420363 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.14■■□□□ 1.14
CPNE1-211ENST00000420363 LRRC53A6NM62 1247 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 ALDH1A2O94788 518 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 PBX1P40424 430 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SGSHP51688 502 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 GEN1Q17RS7 908 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 IQCDQ96DY2 449 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 AGPAT1Q99943 283 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SYT11Q9BT88 431 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.14■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 M0QYT0 321 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 TIMM44O43615 452 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 CALB1P05937 261 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 HLA-FP30511 346 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 FLT3P36888 993 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 UBASH3AP57075 661 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 ENPP2Q13822 863 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 C2CD6Q53TS8 623 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 BNIPLQ7Z465 357 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 KBTBD6Q86V97 674 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 CHSY1Q86X52 802 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 CHPFQ8IZ52 775 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 AHI1Q8N157 1196 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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CPNE1-211ENST00000420363 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 NUP58Q9BVL2 599 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.13■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 A0A1W2PQJ5 194 aa22.12■■□□□ 1.13
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CPNE1-211ENST00000420363 CXCR3P49682 368 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SULT1E1P49888 294 aa22.12■■□□□ 1.13
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CPNE1-211ENST00000420363 PTP4A2Q12974 167 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 NFKBIBQ15653 356 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 IL31Q6EBC2 164 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SDE2Q6IQ49 451 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 MON1BQ7L1V2 547 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 MFN1Q8IWA4 741 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 RNF34Q969K3 372 aa22.12■■□□□ 1.13
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CPNE1-211ENST00000420363 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 GGA2Q9UJY4 613 aa22.12■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 CKAP5Q14008 2032 aa22.11■■□□□ 1.13
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CPNE1-211ENST00000420363 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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CPNE1-211ENST00000420363 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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CPNE1-211ENST00000420363 NME3Q13232 169 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 CCDC6Q16204 474 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 ASIC2Q16515 512 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 ANO7Q6IWH7 933 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 C11orf74Q86VG3 221 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 C3orf20Q8ND61 904 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 FIBINQ8TAL6 211 aa22.11■■□□□ 1.13
CPNE1-211ENST00000420363 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.11■■□□□ 1.13
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