RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 DHX58Q96C10 678 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 WBP1Q96G27 269 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NAV2Q8IVL1 2488 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf142B7Z368 130 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 B8ZZF3 427 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 MID1O15344 667 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DRAP01903 254 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CD70P32970 193 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NXPH1P58417 271 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PKDCCQ504Y2 493 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 MYO19Q96H55 970 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SCML1Q9UN30 329 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SIN3BO75182 1162 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CD58P19256 250 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RXRGP48443 463 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 KCNC4Q03721 635 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CUEDC2Q9H467 287 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 DMAC2Q9NW81 257 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC72A6NJI9 287 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TLR4O00206 839 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 MT-CO3P00414 261 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ACP1P24666 158 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3CAP42336 1068 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TMPRSS3P57727 454 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CST6Q15828 149 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF394Q53GI3 561 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RAB41Q5JT25 222 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PIGZQ86VD9 579 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SERAC1Q96JX3 654 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CCR5P51681 352 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PROX2Q3B8N5 592 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 C8orf34Q49A92 452 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 BROXQ5VW32 411 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TTC9Q92623 222 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 HIC2Q96JB3 615 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 OMDQ99983 421 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 KRT10P13645 584 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 C6P13671 934 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLC8A1P32418 973 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TKTL1P51854 596 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF445P59923 1031 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRF1Q5T601 910 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 OXR1Q8N573 874 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TMC2Q8TDI7 906 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 LMLNQ96KR4 655 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 BACH2Q9BYV9 841 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBL1XO60907 577 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SDC3O75056 442 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 WISP1O95388 367 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 MPOP05164 745 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 E2F1Q01094 437 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 IQUBQ8NA54 791 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TTC17Q96AE7 1141 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 FZD4Q9ULV1 537 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms