RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SNF8Q96H20 258 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF333Q96JL9 665 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZIM3Q96PE6 472 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 FMO2Q99518 471 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF670Q9BS34 389 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 RNF208Q9H0X6 261 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DPH5Q9H2P9 285 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZWILCHQ9H900 591 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MARCH5Q9NX47 278 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 RRN3Q9NYV6 651 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 IL37Q9NZH6 218 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZFATQ9P243 1243 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.26□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 FAM92AA1XBS5 289 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 E7ENQ6 273 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TNFRSF10BO14763 440 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NDC80O14777 642 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TRAPPC3O43617 180 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 OPA1O60313 960 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZBED1O96006 694 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 IGLV3-25P01717 112 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 KRT14P02533 472 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 RARGP13631 454 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DESP17661 470 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TGM2P21980 687 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 RFC2P35250 354 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEA11P43364 429 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFV1P49821 464 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PLTPP55058 493 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 CDH6P55285 790 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ATP11AP98196 1134 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TSPY1Q01534 308 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 VAC14Q08AM6 782 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SCAPQ12770 1279 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SEMA3BQ13214 749 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SLMAPQ14BN4 828 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NOMO1Q15155 1222 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 LLGL1Q15334 1064 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R7Q15435 360 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 HIF1AQ16665 826 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 CA9Q16790 459 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 CFAP58Q5T655 872 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 KAZNQ674X7 775 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PLD5Q8N7P1 536 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ACTL9Q8TC94 416 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 HSPH1Q92598 858 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NTAN1Q96AB6 310 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM209Q96SK2 561 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 KCNK16Q96T55 309 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MED10Q9BTT4 135 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM51Q9NW97 253 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.25□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms