RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TISP43B9A030 160 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FAM153BP0C7A2 387 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 NOS2P35228 1153 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CDK16Q00536 496 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FAM153CQ494X1 144 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC38Q5VT99 294 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 GAD1Q99259 594 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 KDELR1P24390 212 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CASP5P51878 434 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 MT-CO1P00395 513 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RBL1P28749 1068 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 WNT8BQ93098 351 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 HIC2Q96JB3 615 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RAD51BO15315 384 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 WEE1P30291 646 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 DPYSL3Q14195 570 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PGS1Q32NB8 556 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 HSFY1Q96LI6 401 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 GLRA2P23416 452 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 NRCAMQ92823 1304 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RAG1P15918 1043 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2C18P33260 490 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 LENG9Q96B70 501 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM159Q96B96 161 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CD248Q9HCU0 757 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FCHO1O14526 889 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PLSCR1O15162 318 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 KLRC4O43908 158 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CKBP12277 381 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A1P53985 500 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TGM3Q08188 693 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 DPY30Q9C005 99 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 BDNFP23560 247 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PARP6Q2NL67 630 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 GJB6O95452 261 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PLD1Q13393 1074 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 VGLL4Q14135 290 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 AHSPQ9NZD4 102 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A4P14672 509 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2A7P20853 494 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PWP1Q13610 501 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PHKG1Q16816 387 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 KRT84Q9NSB2 600 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 USE1Q9NZ43 259 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF682O95780 498 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MSH3P20585 1137 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1B2P21281 511 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 DLG4P78352 724 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 FAAP100Q0VG06 881 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 STARD3Q14849 445 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 GPR141Q7Z602 305 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4Z1Q86W10 505 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 LGI2Q8N0V4 545 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 APBA2Q99767 749 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC130P13994 396 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA3P25788 255 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PPIL2Q13356 520 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM2Q99965 735 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN10Q9HC96 672 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms