RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CROTQ9UKG9 612 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 TRIM64BA6NI03 449 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 H0YIN7 160 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 RALBP11234 206 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CD247P20963 164 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PSMA2P25787 234 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 WNT7BP56706 349 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 MOGQ16653 247 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 TANKQ92844 425 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 OR52B2Q96RD2 323 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 SLC29A1Q99808 456 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 COPG2Q9UBF2 871 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 NOMO1Q15155 1222 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CGREF1Q99674 301 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CDH19Q9H159 772 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PAK5Q9P286 719 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 A0A1W2PPW3 197 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CFLARO15519 480 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 LYPLA2O95372 231 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ZNF132P52740 706 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 NPNTQ6UXI9 565 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 STARD8Q92502 1023 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ESRRBO95718 433 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 FGD3Q5JSP0 725 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 RCN3Q96D15 328 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CXorf21Q9HAI6 301 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 GIN1Q9NXP7 522 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 TNNI1P19237 187 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 DCKP27707 260 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 MAGEA3P43357 314 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 MAGEA6P43360 314 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CYP2A13Q16696 494 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 FAM47BQ8NA70 645 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 KCTD6Q8NC69 237 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ATP2A3Q93084 1043 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 WDR41Q9HAD4 459 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 TCF7L2Q9NQB0 619 aa22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PTPRJQ12913 1337 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 TPP1O14773 563 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 GARTP22102 1010 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 RGS21Q2M5E4 152 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ERGIC3Q9Y282 383 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 AP4S1Q9Y587 144 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 GIPC1O14908 333 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ERBB2P04626 1255 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 ITGB5P18084 799 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 SPP2Q13103 211 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
OPN3-201ENST00000366554 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms