RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ZNF302Q9NR11 478 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB14O43829 449 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 EXTL3O43909 919 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZBED1O96006 694 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CD1EP15812 388 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RXRGP48443 463 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ACADVLP49748 655 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 DEPTORQ8TB45 409 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FAF2Q96CS3 445 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CDHR1Q96JP9 859 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 POPDC2Q9HBU9 364 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 DNAJC28Q9NX36 388 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SPATA7Q9P0W8 599 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MATN2O00339 956 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 AIM2O14862 343 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 STAMBPO95630 424 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NUDT2P50583 147 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 OAZ1P54368 228 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TMEM126BQ8IUX1 230 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NUF2Q9BZD4 464 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FBXO40Q9UH90 709 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 COQ6Q9Y2Z9 468 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FUOMA2VDF0 154 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 C19orf81C9J6K1 198 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 K7ERI5 159 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FZD9O00144 591 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 XPOTO43592 962 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KLHL41O60662 606 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ADAM23O75077 832 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PRKCHP24723 683 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 IL1R2P27930 398 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NDST2P52849 883 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SLC5A3P53794 718 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CUL2Q13617 745 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 STXBP2Q15833 593 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NRF1Q16656 503 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 C12orf42Q96LP6 360 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CAAP1Q9H8G2 361 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MAN1C1Q9NR34 630 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D23Q9NUY8 699 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MCF2LO15068 1137 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MYL4P12829 197 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ARRB2P32121 409 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TREML2Q5T2D2 321 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZFP1Q6P2D0 407 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RFX6Q8HWS3 928 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SORT1Q99523 831 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RTKNQ9BST9 563 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 EPS15L1Q9UBC2 864 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 EBF1Q9UH73 591 aa17.25■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 LCTP09848 1927 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 VNN1O95497 513 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 EPHA3P29320 983 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KLF10Q13118 480 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PPP2R5DQ14738 602 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZACNQ401N2 412 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RNF148Q8N7C7 305 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 APBB2Q92870 758 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SLC38A7Q9NVC3 462 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZNF195O14628 629 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 H6PDO95479 791 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 GABRB2P47870 512 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SPIDRQ14159 915 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FAXCQ5TGI0 409 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 UBR7Q8N806 425 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 OR5B17Q8NGF7 314 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SPATA18Q8TC71 538 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MSTO1Q9BUK6 570 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RAB6BQ9NRW1 208 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 IGSF9Q9P2J2 1179 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 EMCNQ9ULC0 261 aa17.24■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PRDX6P30041 224 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CYP4A22Q5TCH4 519 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CPNE9Q8IYJ1 553 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SLC7A3Q8WY07 619 aa17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms