RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HSFY1Q96LI6 401 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EDEM2Q9BV94 578 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 WNT16Q9UBV4 365 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MCM3APO60318 1980 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FPGTO14772 594 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CHADO15335 359 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM44O43615 452 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ACSL4O60488 711 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CRCPO75575 148 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GPR1P46091 355 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GNG11P61952 73 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FAM189BP81408 668 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LMNB2Q03252 620 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EHHADHQ08426 723 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CALCOCO2Q13137 446 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 XRCC4Q13426 336 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 INSCQ1MX18 579 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FAM172AQ8WUF8 416 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 P3H4Q92791 437 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CREBBPQ92793 2442 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 P4HA2O15460 535 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TULP3O75386 442 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KRT7P08729 469 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CTHP32929 405 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DLG4P78352 724 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF33AQ06730 810 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MTA1Q13330 715 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RPS6KA1Q15418 735 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 UBXN11Q5T124 520 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EMC10Q5UCC4 262 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 LGMNQ99538 433 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TSGA10Q9BZW7 698 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NT5MQ9NPB1 228 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RRN3Q9NYV6 651 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CNTN3Q9P232 1028 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PKP3Q9Y446 797 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GTH6 734 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EPOPA6NHQ4 379 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS16A8MUM7 142 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLU7O95391 586 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CDC25BP30305 580 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BLKP51451 505 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP3CAQ08209 521 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DSC3Q14574 896 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NR1I3Q14994 352 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DLG2Q15700 870 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CNGA2Q16280 664 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZACNQ401N2 412 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAP9Q49MG5 647 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FAM129CQ86XR2 697 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BBS7Q8IWZ6 715 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCT6BQ92526 530 aa4.57□□□□□ -1.68
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