RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 NCAM2O15394 837 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 RIPK2O43353 540 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 VAV1P15498 845 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SERPINB6P35237 376 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ALDH1A3P47895 512 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 RING1Q06587 406 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ZBTB9Q96C00 473 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 LGMNQ99538 433 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SIK2Q9H0K1 926 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 MAGEA6P43360 314 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC33Q8N5R6 958 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TBC1D31Q96DN5 1066 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 KLC2Q9H0B6 622 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CHADO15335 359 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 APOEP02649 317 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CNPP09543 421 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ELF1P32519 619 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SLC20A2Q08357 652 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF844Q08AG5 666 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 GALNT2Q10471 571 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CBLBQ13191 982 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SLC29A2Q14542 456 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 KCNJ11Q14654 390 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 DENND2CQ68D51 928 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF683Q8IZ20 524 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 HDAC11Q96DB2 347 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0A0MRY4 1105 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 WASH4PA8MWX3 477 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 E9PAM4 449 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 PRRG1O14668 218 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TLL1O43897 1013 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM63AO94886 807 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TTC4O95801 387 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SYN1P17600 705 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 MX2P20592 715 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TUBP50607 506 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 TWF1Q12792 350 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 MTA1Q13330 715 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 VEPH1Q14D04 833 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 MIB1Q86YT6 1006 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 P2RY11Q96G91 374 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SPATA13Q96N96 652 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 LZTS1Q9Y250 596 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 IRAK3Q9Y616 596 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 SLC12A8A0AV02 714 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 LCHNA4D1U4 455 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 RNF40O75150 1001 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 BMPR1AP36894 532 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 PPP3CCP48454 512 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CBX1P83916 185 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 CEP85LQ5SZL2 805 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-202ENST00000338045 C14orf80Q86SX3 495 aa15.91■□□□□ 0.14
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