RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SV2AQ7L0J3 742 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 KRT77Q7Z794 578 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LRRC8AQ8IWT6 810 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 FBXO30Q8TB52 745 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EDEM1Q92611 657 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LRRC45Q96CN5 670 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LRRC39Q96DD0 335 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CEP19Q96LK0 163 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 UCN2Q96RP3 112 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GAL3ST1Q99999 423 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GPR34Q9UPC5 381 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MED16Q9Y2X0 877 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 BDP1A6H8Y1 2624 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CFAP99D6REC4 459 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 POLD2P49005 469 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PRIM2P49643 509 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DNA2P51530 1060 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NOP14P78316 857 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CLDN10P78369 228 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 STX5Q13190 355 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PLCL1Q15111 1095 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NAB2Q15742 525 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ZBTB6Q15916 424 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NFIL3Q16649 462 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TMEM240Q5SV17 173 aa3.22□□□□□ -1.89
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TRDN-201ENST00000334268 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PACS2Q86VP3 889 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ECHDC2Q86YB7 292 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GOLM1Q8NBJ4 401 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 RNF169Q8NCN4 708 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TRIM58Q8NG06 486 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MFSD14AQ96MC6 490 aa3.22□□□□□ -1.89
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TRDN-201ENST00000334268 EHD1Q9H4M9 534 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 RGS18Q9NS28 235 aa3.22□□□□□ -1.89
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TRDN-201ENST00000334268 ATXN10Q9UBB4 475 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 STK39Q9UEW8 545 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EGFL7Q9UHF1 273 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 RWDD3Q9Y3V2 267 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ATP8B3O60423 1300 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PLXNA3P51805 1871 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MYO10Q9HD67 2058 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ZNF233A6NK53 670 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LACTBL1A8MY62 500 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 KCNJ18B7U540 433 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MYO1CO00159 1063 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PPEF2O14830 753 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EPHB6O15197 1021 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TMCC1O94876 653 aa3.22□□□□□ -1.89
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TRDN-201ENST00000334268 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 POLBP06746 335 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 HEXBP07686 556 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NFICP08651 508 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SBK2P0C263 348 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ALDH3A1P30838 453 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GBP1P32455 592 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PBX3P40426 434 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MLH1P40692 756 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PPP1R2P41236 205 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GCLMP48507 274 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TUFMP49411 452 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 RGS7P49802 495 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PTPN5P54829 565 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TUBA4AP68366 448 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CYP24A1Q07973 514 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 KCNMA1Q12791 1236 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 BMPR2Q13873 1038 aa3.22□□□□□ -1.89
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