RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-202ENST00000329966 DMWDQ09019 674 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ARTNQ5T4W7 220 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 TMEM215Q68D42 235 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ALLCQ8N6M5 410 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CHP1Q99653 195 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 IER2Q9BTL4 223 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 NENFQ9UMX5 172 aa21.82■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 GPD1P21695 349 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SDC4P31431 198 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PTPN9P43378 593 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CCR3P51677 355 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PTPN5P54829 565 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 HDAC4P56524 1084 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 FBXL22Q6P050 247 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 IGSF8Q969P0 613 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ACOX2Q99424 681 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 USP34Q70CQ2 3546 aa21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 F9P00740 461 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 FSCBQ5H9T9 825 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 MPP7Q5T2T1 576 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 DRC7Q8IY82 874 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ZNF653Q96CK0 615 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 LMLNQ96KR4 655 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PHOX2BQ99453 314 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SIK2Q9H0K1 926 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SGK1O00141 431 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CCP110O43303 1012 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ADAM23O75077 832 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CD70P32970 193 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.8■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 F5H5T6 163 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 WASP42768 502 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 NHLH1Q02575 133 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 TC2NQ8N9U0 490 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 THAP2Q9H0W7 228 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PARVAQ9NVD7 372 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 R4GN57 208 aa21.79■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ATG13O75143 517 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 NUMBP49757 651 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 DMC1Q14565 340 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 SYT13Q7L8C5 426 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 STRADAQ7RTN6 431 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ADIPOR2Q86V24 386 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 VPS36Q86VN1 386 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 MFN1Q8IWA4 741 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 CCDC185Q8N715 623 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 NELL1Q92832 810 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 HHIPQ96QV1 700 aa21.78■■□□□ 1.08
USP45-202ENST00000329966 GGA2Q9UJY4 613 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms