RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 C4orf22Q6V702 233 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 BHLHA9Q7RTU4 235 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 IQCKQ8N0W5 287 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FIBCD1Q8N539 461 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF461Q8TAF7 563 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM32Q8TC27 787 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO32Q969P5 355 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OSBPL2Q9H1P3 480 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDH9Q9HC56 1237 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MAFFQ9ULX9 164 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 INSL6Q9Y581 213 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PQH9 124 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM92AA1XBS5 289 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NCAM2O15394 837 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PPFIA2O75334 1257 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 URODP06132 367 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RARGP13631 454 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GOT1P17174 413 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 AMPD1P23109 780 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ELF1P32519 619 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS41P49754 854 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGA8P53708 1063 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RELBQ01201 579 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DSG1Q02413 1049 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CREMQ03060 361 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FPGSQ05932 587 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MTA1Q13330 715 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2R5DQ14738 602 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PDK1Q15118 436 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF12Q16514 161 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 P3H1Q32P28 736 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC24Q6UX98 284 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TMC3Q7Z5M5 1100 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SCD5Q86SK9 330 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PYROXD2Q8N2H3 581 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM71DQ8N9W8 422 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB11Q96P15 392 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HAPLN3Q96S86 360 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TKTL2Q9H0I9 626 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SMOC2Q9H3U7 446 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OR12D3Q9UGF7 316 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD54BQ9Y620 910 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HACD1B0YJ81 288 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 C2CD2LO14523 706 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ABLIM3O94929 683 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR7P34969 479 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH1A3P47895 512 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PMS2P54278 862 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TPI1P60174 286 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF10Q12962 218 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MORF4L2Q15014 288 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 IZUMO3Q5VZ72 239 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NPNTQ6UXI9 565 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RFX8Q6ZV50 586 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CROCCP2Q86T23 111 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TADA2BQ86TJ2 420 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TAC4Q86UU9 113 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC45BQ8IWX7 931 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS52Q8N1B4 723 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 BADQ92934 168 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms