RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CHKAP35790 457 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF683Q8IZ20 524 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRELID2Q8N945 189 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMRP1Q8NCR6 262 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf54Q8WWF1 131 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR2E1Q9Y466 385 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRGXA6NNA5 263 aa28.25■■■□□ 2.11
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