RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 TREHO43280 583 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 POLBP06746 335 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 MGAT1P26572 445 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 HCAR3P49019 387 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 SCAPQ12770 1279 aa20.11■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 RRN3Q9NYV6 651 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.11■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 DCLK1O15075 740 aa20.1■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.1■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 Q9Y3F1 56 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 CAPN14A8MX76 684 aa20.08■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.08■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC42Q9Y546 428 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-201ENST00000311008 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.08■□□□□ 0.81
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SPNS1-201ENST00000311008 MYL3P08590 195 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 GP5P40197 560 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFV1P49821 464 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 AQP5P55064 265 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 PDE1BQ01064 536 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 TTC7BQ86TV6 843 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 TEX9Q8N6V9 391 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS1-201ENST00000311008 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.08■□□□□ 0.8
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