RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MESDQ14696 234 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 FBXL22Q6P050 247 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 CD101Q93033 1021 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NTAN1Q96AB6 310 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 CACNG3O60359 315 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TULP3O75386 442 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 EFHC2Q5JST6 749 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 C14orf80Q86SX3 495 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 EXOC4Q96A65 974 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf74Q96LT6 269 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 FOXQ1Q9C009 403 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 DEC1Q9P2X7 70 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 DLL1O00548 723 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 SRGAP2O75044 1071 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MTA2O94776 668 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PROSCO94903 275 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PCK1P35558 622 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 KDSRQ06136 332 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC31Q6UY01 552 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 IGSF8Q969P0 613 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PEBP4Q96S96 227 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PNKPQ96T60 521 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 LTB4R2Q9NPC1 389 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 OR12D3Q9UGF7 316 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 FZD10Q9ULW2 581 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 USP18Q9UMW8 372 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM24O15164 1050 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 AIF1P55008 147 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 SCAPQ12770 1279 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 TCEAL1Q15170 157 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 MPP7Q5T2T1 576 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 FAM170BA6NMN3 283 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 E9PAM4 449 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 TCF4P15884 667 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP25P42331 645 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 DGKGP49619 791 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 ERMARDQ5T6L9 678 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 PYROXD2Q8N2H3 581 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 OSBPL2Q9H1P3 480 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 ZWILCHQ9H900 591 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 IRAK1P51617 712 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 MESP2Q0VG99 397 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 KIF5AQ12840 1032 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 SMTNL2Q2TAL5 461 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM196Q5HYL7 178 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 MFN1Q8IWA4 741 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 NELL2Q99435 816 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 FAM72CH0Y354 149 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 PJA2O43164 708 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 BUB1O43683 1085 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 KAT7O95251 611 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 APODP05090 189 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 IL1R2P27930 398 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 HADHBP55084 474 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD4-201ENST00000306324 CDH18Q13634 790 aa23.05■■□□□ 1.28
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