RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.14■■□□□ 1.3
ATMIN-201ENST00000299575 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.14■■□□□ 1.3
ATMIN-201ENST00000299575 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
ATMIN-201ENST00000299575 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.14■■□□□ 1.3
ATMIN-201ENST00000299575 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.14■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 BLOC1S6Q9UL45 172 aa23.14■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 CHKAP35790 457 aa23.14■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 BTKQ06187 659 aa23.14■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 GPR142Q7Z601 462 aa23.14■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PHF21BQ96EK2 531 aa23.14■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 MMP8P22894 467 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 SERPINB3P29508 390 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 MMRN1Q13201 1228 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 NAB1Q13506 487 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 CACHD1Q5VU97 1274 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ABHD2P08910 425 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 DSG1Q02413 1049 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 RETSATQ6NUM9 610 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 DACH2Q96NX9 599 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 TRIM16O95361 564 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 GALNTL6Q49A17 601 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 IQCKQ8N0W5 287 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 C12orf29Q8N999 325 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 GPR20Q99678 358 aa23.13■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 GRM5P41594 1212 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 NME5P56597 212 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 MTA1Q13330 715 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 HELQQ8TDG4 1101 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 YME1L1Q96TA2 773 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 TBC1D4O60343 1298 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 MT-CO1P00395 513 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PSMB4P28070 264 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 CRABP2P29373 138 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 CDK7P50613 346 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PLIN5Q00G26 463 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 LPCAT1Q8NF37 534 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PWWP2AQ96N64 755 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 UBDO15205 165 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 SNX3O60493 162 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 TBL1YQ9BQ87 522 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF670Q9BS34 389 aa23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ADAMTS3O15072 1205 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 AGKQ53H12 422 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 TNIP2Q8NFZ5 429 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 THAP11Q96EK4 314 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 TCHHQ07283 1943 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 B4GALT4O60513 344 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 FUT11Q495W5 492 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 DEFB107AQ8IZN7 70 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ATP6V1G2O95670 118 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 CYP2C18P33260 490 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PRKAA2P54646 552 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 WLSQ5T9L3 541 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 MAP2K5Q13163 448 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.11■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 FKBP6O75344 327 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ERVK-10P10266 1014 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 USP6NLQ92738 828 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 NMRAL1Q9HBL8 299 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 RGS18Q9NS28 235 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.1■■□□□ 1.29
ATMIN-201ENST00000299575 CCT7Q99832 543 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms