RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298307.9

KLHDC2-201, Transcript of kelch domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLHDC2, Length 5,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2-201ENST00000298307 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TNFRSF25Q93038 417 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 MARK4Q96L34 752 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RMND5AQ9H871 391 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TRIM38O00635 465 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TPH1P17752 444 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 GRIA3P42263 894 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 KRT33BQ14525 404 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 AMHR2Q16671 573 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.3■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 PXDNQ92626 1479 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 MYOM1P52179 1685 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 BORCS5Q969J3 196 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RERGLQ9H628 205 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TSPOAP1O95153 1857 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CAPN8A6NHC0 703 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 NOL4O94818 638 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 SETD9Q8NE22 299 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TTC23LQ6PF05 361 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 WWOXQ9NZC7 414 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 MAGEC1O60732 1142 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.29■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TOMM70O94826 608 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 VCLP18206 1134 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CRABP2P29373 138 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ITPK1Q13572 414 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 BROXQ5VW32 411 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ZBTB46Q86UZ6 589 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RAD54BQ9Y620 910 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 HMGCRP04035 888 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 DDX5P17844 614 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 IL12RB1P42701 662 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TP53BP2Q13625 1128 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TLK2Q86UE8 772 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ERVK-10P10266 1014 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CCNA2P20248 432 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 NR2C2P49116 596 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ACER1Q8TDN7 264 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 PHF21AQ96BD5 680 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 SESN1Q9Y6P5 492 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 POMKQ9H5K3 350 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 HMBSP08397 361 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 USP46P62068 366 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 DDR2Q16832 855 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.28■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CDH17Q12864 832 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 POU6F1Q14863 301 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 FLCNQ8NFG4 579 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 SHC3Q92529 594 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 RCN3Q96D15 328 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 EBF2Q9HAK2 575 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 JCADQ9P266 1359 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.27■□□□□ 0.84
KLHDC2-201ENST00000298307 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms