RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LATS1O95835 1130 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ADH1BP00325 375 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MPOP05164 745 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV4-34P06331 123 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HMBSP08397 361 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ADORA2BP29275 332 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 STAT6P42226 847 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 GALCP54803 685 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN6P56747 220 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NXPH1P58417 271 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL6P60660 151 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 EFEMP1Q12805 493 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NCOA4Q13772 614 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CST6Q15828 149 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MBLAC2Q68D91 279 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM1BQ8NB78 822 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF139Q8WU17 664 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE4BO95155 1302 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTA1P02549 2419 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PP55 124 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC12A8A0AV02 714 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MDM4O15151 490 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IRAK2O43187 625 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CSO75390 466 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.2□□□□□ -1.1
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PGGT1B-201ENST00000296642 GOT1P17174 413 aa8.2□□□□□ -1.1
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PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2J2P51589 502 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP5P51878 434 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF11P52732 1056 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NDST1P52848 882 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP24A1Q07973 514 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 COLEC12Q5KU26 742 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MPP7Q5T2T1 576 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC39CQ8N584 583 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR48Q8TAF3 677 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM84AQ96KN4 292 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR70Q9NW82 654 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP83Q9Y592 693 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MYLKQ15746 1914 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KNL1Q8NG31 2342 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.19□□□□□ -1.1
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