RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNX3O60493 162 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 MT-ND3P03897 115 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CACNA2D1P54289 1103 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLC1Q07866 573 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTK7Q13308 1070 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 MUM1Q2TAK8 710 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGEB18Q96M61 343 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDIT4Q9NX09 232 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SENP1Q9P0U3 644 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 FZD10Q9ULW2 581 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 DAB1O75553 588 aa21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUN1O94901 812 aa21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 FOXN2P32314 431 aa21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCNFP41002 786 aa21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMOQ99835 787 aa21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 H3BRJ5 948 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 GABRDO14764 452 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 MFSD11O43934 449 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP46P62068 366 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHST12Q9NRB3 414 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 MGEA5O60502 916 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 BDNFP23560 247 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRIA1P42261 906 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC1A5Q15758 541 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCNN1AP37088 669 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCALDP61601 193 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 METTL23Q86XA0 190 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM155BO75949 473 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSTT1P30711 240 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 NR2C2P49116 596 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCSK1P29120 753 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 FERMT1Q9BQL6 677 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPCSQ9HAB8 311 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAAP100Q0VG06 881 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPY6RQ99463 290 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAC1P20366 129 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYLPFQ96A32 169 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 GBP5Q96PP8 586 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNK1O00180 336 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ODC1P11926 461 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 CRADDP78560 199 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARCQ7LC44 396 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ASMTLO95671 621 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADRA1DP25100 572 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 DAOAP59103 153 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 RCN2Q14257 317 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDH9Q9ULB4 789 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 LTFP02788 710 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 VAV1P15498 845 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 RIPK1Q13546 671 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ITIH4Q14624 930 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 UPP1Q16831 310 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 MPP5Q8N3R9 675 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms